行百里者半九十

• 2023 年
  • 5 月
    • 使用Jupyterlab开发时进行模块和包的完全重载
    • 使用pybedtools随机选取region
    • 使用pybedtools对overlap的bed筛选
• 2022 年
  • 11 月
    • add new
  • 10 月
    • 使用 R 画 radar 雷达图
    • cytoband信息
    • fa.fai的含义
    • from __future__ import annotations的作用
    • samtools 对 bam 取样
    • GATK_Call_SNP
    • Barcoding of individual DNA molecules
    • Illumina SBS sequencing
    • FASTQ与 FASTA
    • Deeptools
  • 7 月
    • 使用python判断命令行工具是否存在于PATH中
    • conda | pip 环境的导出与导入
  • 6 月
    • 下载GATK bundle
    • 特性练习
    • JASPAR
    • VCF
    • BAMTOOLS 用法示例
    • PyCharm常用设置
    • .gitignore 通用模板
    • GitHub提交文件过大对的解决方案
    • 我常用的PyCharm插件
    • 2022-03-29 Python库学习
    • 概率论与数理统计（浙江大学）-样本空间，随机事件
    • 概率论与数理统计（浙江大学）-绪论
    • Seaborn 绘制靶向深度测序 Target-seq 的 Barplot 并分组
  • 5 月
    • Seaborn绘制 distplot 数据分布
    • Spyder install
  • 4 月
    • 基因组文件坐标系统
    • 使用Python的os库实现一个简单的tree命令
    • 使用git config --global设置用户名和邮件
  • 3 月
    • Hi-C-数据分析-数据回贴
    • 我的condarc镜像
    • Seaborn绘制barplot并添加显著性检验
    • AGCT作为列名时（bmat）寻找突变位点
    • CollectInsertSizeMetrics
    • github上fork原项目，如何将本地仓库代码更新到最新版本？
    • 如何自学生物信息学
    • gatk4加速
    • ChIP-seq
    • 人类各染色体长度与基因数量
    • 构建WGS主流程
    • 提取参考基因组某个位置的碱基
    • RIdeogram 画 核型图 | 染色体 + 位点注释、表达量
    • CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagment
    • cutadapt使用指南
    • ggridges
    • HISAT-3N
    • 转录组差异表达分析教程
    • pybedtools介绍
    • Alignment Tools 比对工具比较专题
    • clusterProfiler
    • GEO上传大小限制
    • samtools 用法示例
    • ggplot2 散点图 log10
    • pandas excel保存多个sheet
    • Linux磁盘查看及扩容
    • linux ssh 代理隧道 socks
    • find awk bmat 汇总
  • 2 月
    • 贝叶斯决策
    • 清空github仓库历史以减小仓库体积
    • barplot + point
• 2021 年
  • 12 月
    • Python多线程(threading)、多进程(multiprocessing)与异步IO(asyncio)
  • 11 月
    • Numpy-基础
    • Duncan post hoc test in Python
  • 10 月
    • Hi-C-数据分析-背景知识
    • Jupyter-lab在macos上的快捷键记录
    • Bioinfo_Web_Databases_GEO数据库下载数据_更新版
    • 使用homer对peak进行注释
    • samtools inxstats快速查看回贴后的reads数分布
    • 测序量与测序深度的理解
    • 绕过内网防火墙给只能ssh的服务器翻墙装R包以及使用github
    • bam转fastq一直WARNING，并且两个fastq结果文件都是空的
    • 提取bam_sam文件指定区域reads
    • 提取未比对成功的测序数据
    • 使用生成器读取fasta文件
    • 合并不同lane的测序数据用zcat还是cat
    • MySQL-数据库设计-MySQL多表操作命令
    • MySQL-数据库设计-MySQL数据库操作与常用数据类型
    • MySQL-数据库设计-MySQL可以更快！
    • MySQL-数据库设计-MySQL的查询操作
    • MySQL-数据库设计-MySQL的增删改操作
    • MySQL-数据库设计-常用字段约束与创建MySQL表结构
    • MySQL-数据库设计-数据库介绍与MySQL的安装配置
    • latex-katex-doc
    • Hexo的其他问题
    • 对部分博文进行加密
    • 使用Hexo搭配GitHub搭建个人博客-部署到私人服务器而不是github上
    • 使用Hexo搭配GitHub搭建个人博客-配置细节
    • 使用Hexo搭配GitHub搭建个人博客-初步搭建
    • CSS让HTML看起来绚丽多彩
    • Web前端开发的核心JavaScript
    • JQuery让你操作元素更简单
    • HTML的语法
    • IGV批量截图代码示例
    • Jupyterlab好用的插件
    • Seaborn stacked barplot 堆叠柱状图
    • PrettyTable
  • 9 月
    • Bioinfo_Web_Databases_GEO数据库上传数据
    • Bioinfo_Web_Databases_GEO数据库下载数据
    • Bioinfo_Pysam_tutorial
    • Bioinfo_Snakemake_install
    • Pandas速查手册
  • 8 月
    • Python 定时任务的实现方式-APScheduler定时框架
    • HomeBrew的安装，使用brew配置命令和必要软件
    • Git基本用法与GitHub仓库的初步运用
    • 利用pipe批量kill进程
    • pigz
    • md5sum
    • rsync
    • r-R语言入门基础-R语言绘图基础
    • r-R语言入门基础-抛硬币试验
    • r-R语言入门基础-向量案例集
    • r-R语言入门基础-函数
    • r-R语言入门基础-循环结构
    • r-R语言入门基础-选择结构
    • r-R语言入门基础-因子
    • r-R语言入门基础-数据框
    • r-R语言入门基础-列表
    • r-R语言入门基础-数组
    • r-R语言入门基础-矩阵-矩阵的编辑
    • r-R语言入门基础-矩阵-矩阵中元素的访问
    • r-R语言入门基础-基本函数
    • r-R语言入门基础-向量-向量的排序
    • r-R语言入门基础-向量-向量的编辑
    • r-R语言入门基础-向量-向量的访问
    • r-R语言入门基础-向量-元素的命名
    • r-R语言入门基础-向量-创建向量
    • 罗列文件夹中的文件 | List the Files in a Directory/Folder
    • 给Ubuntu或Debian设置主机名hostname
    • zsh配置
    • Pandas
  • 4 月
    • 保存文件时去除文件名中的非法字符
  • 3 月
    • 使用snakemake搭建工作流程
• 2020 年
  • 10 月
    • argparse
  • 4 月
    • Matplotlib
    • Numpy
    • 数据分析好助手——Jupyter-notebook
    • urllib
    • json模块
    • 通过跳板机在本地使用工作机的jupyter-lab
    • re模块使用案例
    • 正则表达式
  • 3 月
    • yield逐行读取大文件
    • encode
    • error的处理
    • 函数即变量
    • map()
    • reduce()
    • 匿名函数
    • 装饰器@
    • 列表生成式
    • 生成器
    • 迭代器
    • 类的继承和多态
  • 2 月
    • 万物皆对象
    • for loop
    • Built-in functions
    • tuple
    • string
    • dict
    • PEP8 编码规范中文版
    • module
    • member operator
    • keyword | function | method
    • function